15 сентября 1913 года в Саратове были открыты Высшие сельскохозяйственные курсы на правах вуза. Четыре года спустя курсы были преобразованы в Саратовский сельскохозяйственный институт. С 1917 по 1921 годы – в Вузе занимался научно-исследовательской работой и преподавал один из величайших генетиков мира – Николай Иванович Вавилов, имя которого увековечено в названии университета.
Экономический факультет был основан в 1952 году. За более чем 50 лет своего существования факультет подготовил около 6 тысяч специалистов в области организации и планирования сельскохозяйственного производства, планирования народного хозяйства, менеджмента, экономики и управления внешнеэкономической деятельностью предприятий и фирм. Выпускники факультета работают в различных отраслях народного хозяйства, являются руководителями государственных структур, предприятий, научно-исследовательских институтов и высших учебных заведений. В разные годы факультет возглавляли: Бердников Д.С. (1954-1959 гг.), Гермашев Г.П. (1965-1973 гг.), Фадеев В.П. (1973-1982 гг, 1991-2000 гг.), Смотров Н.А. (1982-1984 гг.), Боков О.Г. (1984-1987 гг.), Торопыгин А.С. (1987-1991 гг.), Батеенков П.С. (2000-2001 гг.). В январе 2001 года факультет был включен в состав института агробизнеса СГАУ им Н.И.Вавилова, который возглавлял д.э.н., профессор, заслуженный экономист РФ Глебов И.П. После реорганизации института агробизнеса профессор Глебов И.П. возглавлял экономический факультет (2005-2009 гг.).
Факультет бухгалтерского учета был организован в июле 2005 г. на базе института агробизнеса (2000-2005 гг.) и экономического факультета, функционировавшего с 1952 г., подготовка экономистов по специальности «Бухгалтерский учет» началась с 1957 г. В 2009 году после реорганизации ВУЗа переименован в финансово-экономический факультет.
Для обеспечения регионального АПК инновационно-ориентированными специалистами в области экономики и управления в 2009 г. был создан факультет менеджмента и агробизнеса в результате слияния трех факультетов: экономического, менеджмента и агропромышленного рынка.
В 2013 году произошло слияние факультета менеджмента и агробизнеса с финансово-экономическим факультетом.
Факультет экономики и менеджмента является полноправным экономическим агентом, участвующим в инновационном развитии нашего региона.
Во-первых – это подготовка кадров, повышающая качество рабочей силы.
Во-вторых – ученые факультета играют специфическую роль в открытии доступа к знаниям: научные публикации, семинары, конференции – способы передачи академического знания частному сектору.
В-третьих – взаимодействие с регионом, вклад ученых в генерацию инноваций и трансфер знаний на региональном уровне.
В настоящее время прием абитуриентов на факультете осуществлялся по направлениям подготовки бакалавриата 38.03.01 – Экономика, 38.03.02 – Менеджмент, 30.03.06 – Торговое дело и магистратуры 38.04.01 – Экономика, 38.04.02 – Менеджмент на очную, очно-заочную и заочную формы обучения. Важнейшим приоритетом стратегического развития факультета в планируемом периоде является подготовка конкурентоспособных бакалавров и магистров, обладающих профессиональными и личностными компетенциями, составляющих современную кадровую элиту, способную решать социально-экономические задачи, стоящих перед регионом, страной. В перспективе планируется начать набор на новые направления подготовки уровня бакалавриата и магистратуры 38.03.05 и 38.04.05 «Бизнес информатика». Целью воспитательной деятельности факультета было и остается создание оптимальных социокультурных и образовательных условий для развития гармонично и всесторонне развитой личности, подготовки компетентного специалиста, творчески мыслящего, способного к самосовершенствованию и самореализации, обладающего ответственностью и гражданским самосознанием.